成熟的黑木耳，颜色由深转浅；耳片舒展变软，肉质肥厚耳根收缩，子实体腹面产生白色孢子粉时，应立即采收。
采收的时间，最好在雨后初晴或晴天早晨露水未干，耳片柔软的进行。采收时用手指齐耳基部摘下，并把耳根处理干净，以免溃烂。如遇阴雨天，成熟的耳片也要采摘，以免造成烂耳。
采下的黑木耳，摊薄在晒席上趁热晒干。未干前不得翻动，防止耳片内卷失去美观。阴雨天可把湿耳在室内摊开晾干，等晴天再晒或用炭火烘干。干制的黑木耳，随即装入塑料袋，藏放干燥通风处，以防吸潮变质。
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