菇棚内害虫危害给食用菌发展造成很大障碍。为缓解这一矛盾，现介绍菇棚内的主要害虫及防治方法。
一、菌虱 菌虱是一种螨类，个体很小，爬行较快，主要取食子实体和菌丝造成危害。防治时首先应杜绝虫源侵入菇棚，因其主要来源于仓库、饲料间的各种饲料里，所以利用仓库，鸡舍等作为养菌室时要彻底消毒，并用石灰刷墙，使用前再用敌敌畏熏蒸1次；培养期间发现菌虱可用棉球沾50%敌敌畏悬挂熏蒸或喷施1%硫酸尼古丁溶液，也可用猪骨头等带腥味的东西喷上亚硫磷等农药后放在培养块附近，把菌虱引诱上去，再取出后烧掉或用开水烫死。
二、线虫 线虫主要栖息于土壤中，随覆土进入菇房。将培养料经巴氏消毒处理后能有效杀灭线虫。线虫是一种无色的小蠕虫，体形极小，仅1毫米左右。幼虫侵害菌丝体和子实体，开始时菌盖变黑，以后整个子实体全变黑腐烂并有霉臭味。防治方法：蒸料时要使蒸汽充分接触培养料，以杀死全部线虫。出菇后，可用50毫克/公斤的硫化锌喷施培养块来防治其危害。
三、跳虫 跳虫又名烟灰虫。具有灵活的尾部，弹跳自如，体具蜡质，不怕水。常分布在菇床表面或潮湿的阴暗处咬食子实体。出菇前发生可用1:1000倍的敌敌畏加少量蜜糖诱杀。或用亚砷酸制剂或有机磷制剂涂于地瓜片上进行诱杀。出菇后一般不能直接使用农药，此时可利用新鲜桔皮0.25—0.5公斤切成碎片，用纱布包好榨取汁液，再加入0.5公斤温水之后用1:20的比例喷施2—3次，防跳虫有效率达90%以上。
四、蛞蝓
蛞蝓俗称鼻涕虫，系软体动物，身体裸露，无外壳。其畏光怕热，白天躲在砖、石块下面及土缝中，黄昏后陆续出来取食为害，天亮前又躲起来。防治方法：米糠或豆饼加入2%砷酸钙或砷酸铝制成毒饵诱杀，也可用15—20倍氯化钠溶液地面喷洒驱除成虫。晚上9—10点钟是它们集中活动时期，这时可进行人工捕捉。
五、蓟马
蓟马成虫黑色，体小，身体略扁，复眼突出，若虫桔红色。其主要吸取菌体汁液，严重时可导致菌体萎缩。防治方法：用40%乐果乳剂1500—2000倍液喷，或90%敌百虫、50%马拉硫磷1000—1500倍液喷雾，防效可达80—90%.
六、蝼蛄 防治蝼蛄用毒饵诱杀效果最好。其配方为敌百虫50克，米糠或麦麸1500克炒香，糖50克，白醋250毫克充分混合后撒于地面上，蝼蛄、蚊类食后立即死亡。
七、螨虫 螨虫主要潜伏在粪肥中，可随培养料侵入菇房，将培养料进行巴氏消毒处理后能有效地控制其发生。另外，在堆料时拌入三氯杀螨醇或在床面上喷洒菊乐合酯1000倍液和敌敌畏1000倍液。严重时用磷化铝熏蒸处理也可。
八、其他害虫 伪步行虫、蛀板虫、四斑丽钾等可用鱼藤精500—800倍液喷雾或80%敌敌畏1000—1500倍液喷雾都可取得较好防效。白蚁是南方一大害虫，其主要危害茯灵等菌类。挖巢灭蚁是避免或减少白蚁危害的有效方法。另外还可用臭椿树枝法即将菇棚周围挖一小沟，把新鲜臭椿树枝均匀地放在沟内，用土盖上，对白蚁有很强的驱避作用。
