1．底肥的施用根用芥菜喜富含有机质的土地，所以在整地前一定要施入足量的有机肥，一般可用农家肥或堆沤过的城市垃圾，然后加入草木灰和过磷酸钙。详细用量，视土壤肥力而定，一般每667平方米用农家肥3500-4000kg，草木灰150kg，过磷酸钙25公斤，遍撒于地表，然后耕翻入土，耕翻深度达 40-50厘米，耙平作畦。
2．追肥的施用直播根芥成长发育时期可视详细状况追肥5次。当小苗的子叶展开后进行第一次追肥，用粪水比为1：7的稀粪尿每667平方米施用500kg。第一次减苗后，中耕锄草时追第二次肥，用比例为1：5的粪尿水每667平方米施800kg。定苗后，植株成长快速，需要充盈的肥水，可进行第三次追肥，每667平方米施硫酸铵10-15kg。进入连作期后，为促使肉质根膨大，可追第四次肥，每667平方米用尿素10公斤、硫酸钾4kg。当进入肉质根膨大盛期，追加第五次肥，可加快肉质根膨大，提升产量，此次用氮、磷、钾复合肥每667平方米施15-20公斤。追肥施用时.要早施，并配合施用磷、钾肥，若追肥过晚、氮偏多，就会使地上部成长过盛，影响肉质根膨大。
3．叶面肥的施用根芥成长过程中需硼较多，进入幼芽期，可叶面喷施0.1%-0.25%的硼砂或硼酸。在生育初期可喷0.02%-0.05%的钼酸铵水溶液，在露肩后，每周叶面喷施1次2%的过磷酸钙，有显着的增产成效。
