一、采收一般于霜降至立冬采收。以管状花（即花心）散开2/3时为采收适期，若将全部开放的花朵采下后加工质量差。采收菊花要选晴天露水干后进行，否则容易腐烂、变质、色逊、质差。
二、加工菊花品种繁多，各地均有独特的传统加工方法。
1.亳菊在花大部分盛开齐放、花瓣普遍洁白时，连茎秆割（折）下，分二、三次收完。扎成小捆，倒挂于通风干燥处晾干3至4周，不能曝晒，否则香气差。干燥快的色白，干燥慢的为淡黄色，至花有八成干时，即可将花摘下，置熏房内用硫磺熏白。熏后再摊晒1天即可干燥。然后装入木板箱或竹篓，内衬牛皮纸，1层菊花一层纸相间压实贮藏。一般亩产50千克，高产达150千克。
2.滁菊菊花采后，阴干，熏白，晒至六成干时，用竹筛将花头筛成圆球形，再晒至全干即成。晒时切忌用手翻动，可用竹筷轻轻翻动晾晒。
3.贡菊菊花采后，置烘房内烘焙干燥，以无烟的木炭作燃料。烘房温度控制在40至50℃之间。烘时将贡菊摊、竹帘上，当第1轮菊花烘至九成干时，再转为第2轮。第2轮的温度较第1轮低，约30至40℃。当花色烘至象牙白时，即可从烘房内取出，再置通风干燥处阴至全干。此法加工菊花，清香而有甘味，花色鲜艳而又洁白，且挥发油损失甚少，较晒熏、蒸法加工质量为好。尤其是采用硫磺熏蒸，菊花被硫和硫化物污染，严重影响药菊的质量和卫生。
4.杭菊杭菊花加工采用烧柴的小灶蒸花的办法，铁锅外缘直径50多厘米，把菊花铺放在蒸花盘内（蒸花盘用竹篾编成，周边斜上，上缘直径约37至39厘米），厚约3厘米，过厚不易蒸好。锅水烧开后，放入2至3只蒸花盘，上盖木锅盖。蒸花火力要猛而均匀，每蒸一次加一次热水。锅水不宜过多，以免水沸到蒸花盘，影响菊花质量。蒸的时间约4至4.5分钟，过生过熟过头成“湿腐状”，不易晒干；蒸的时间过短，则出现生花，刚出笼时花瓣不贴伏，颜色灰白，经风一吹则成红褐色。过久花熟都影响质量。蒸好的菊花放在竹帘上晒，菊花未干不要翻动，晚上收进室内不能压，晒3天后翻身一次，约晒6～7天后，收起贮藏数天以后再晒1～2天，花心完全变硬即可贮藏。
