秋季花卉病虫害的种类主要有：叶斑病、黑斑病、炭疽病、枯萎病、白粉病、介壳虫、蚜虫、蓟马、天牛、木蠹蛾、粉虱、斑潜蝇、螨类(红蜘蛛、跗线螨)、线虫等。
叶斑病主要为害茶花、桂花、榆树、兰花、凤梨、罗汉松、散尾葵等，一般病叶率为15%～30%，重的达50%以上。
黑斑病主要为害月季、玫瑰、菊花等，花卉受害较普遍，其为害率一般为20%～40%。
炭疽病为害花卉种类多，常见的受害花卉有兰花、万年青、茶花、米兰、九里香、橡皮树、白兰花、君子兰、竹芋类、棕榈科花卉等。花卉叶片受害率为10%～30%，严重的在90%以上。
此外，白粉病为害紫薇、芍药等，枯萎病为害棕榈科花卉(苗期)、菊花等。
介壳虫是发生较普遍的虫害，常为害苏铁、散尾葵、白兰、桂花、茶花、含笑、九里香、榕树、榆树、福建茶、棕竹等。在种植密度大、荫蔽度高的环境下发生重，若防治不及时易造成落叶、枯枝，甚至植株死亡。
螨类为害的花卉种类很多，常见的有柑橘类、榆树、万寿菊、月季、玫瑰、苏铁、竹类等。秋季是螨类为害的高峰期，必须使用对口农药及时防治。
另外，蓟马常为害细叶榕等。天牛、木蠹蛾在移栽后的榕树、仿伞枫、苏铁等的粗大枝干上钻蛀为害，一般为害株率为10%～40%。粉虱、蚜虫、斑潜蝇主要为害菊花、芍药、杜鹃等类花卉。线虫发生较普遍，且不易被发现，为害对象主要有万年青、棕榈科类、菊花等。
花卉病虫害防治应以预防为主，尤其值得注意的是如何避免污染的水源导致病害的流行。另外，必须对症下药，及时防治。
1.花场内要及时清理病残枝叶，使用干净的水源浇灌花卉，合理安排场中花卉品种的种植布局，以减少病虫源的反复感染和相互传播。
2.对症下药，及时施药防治。
病害防治：叶斑病、黑斑病可选用托布津、多菌灵、代森锰锌、氧氯化铜等农药进行防治，炭疽病用施保功、使百克或代森锌等防治，白粉病用灭病威、胶悬剂、粉锈宁等防治。
虫害防治：介壳虫宜选用速扑杀、氧化乐果防治，螨类用哒螨灵、克螨特、双甲脒等防治，蓟马、粉虱用吡虫啉、稻飞虱、万灵等防治，斑潜蝇用杀虫双、巴丹等防治，线虫则用呋喃丹、米乐尔防治。如发生钻蛀性害虫，除表面喷施农药外，还可采用农药灌注、混坭浆涂抹等方法进行防治。
